El Ministerio de Salud, como instancia rectora del sector salud, formula la Estrategia Nacional de Salud Sexual y Reproductiva (ENSSR), instrumento normativo y orientador que permite reducir las brechas existente de atención en SSR, sobre todo en los grupos más excluidos socialmente, y pone a la disposición un abanico de opciones para mejorar el nivel y calidad de la vida sexual y reproductiva de la población en todo su ciclo de vida.
La Estrategia Nacional de Salud Sexual y Reproductiva es el resultado de un proceso de consulta, negociación y consenso entre los diferentes actores del sector salud y, surge en un contexto saturado de programas verticales e insuficiente liderazgo para la alineación y armonización de la cooperación externa en el Ministerio de Salud.
La ENSSR propone mecanismos innovadores para reorganizar los servicios de salud sexual y reproductiva en el Ministerio de Salud alrededor de un eje central, ser una guía organizativa para otros proveedores de servicios de SSR, sustentado en un plan nacional y apoyado por un nuevo mecanismo de alineación y armonización de la cooperación externa, El Enfoque Sectorial en Salud.